入职三年没签劳动合同的处理可能会受到以下特殊情况或例外情形的影响：
1. 劳动者属于非全日制用工：根据《劳动合同法》第六十九条，非全日制用工可以订立口头协议，因此若劳动者为非全日制用工（如每日工作不超过四小时，每周累计不超过二十四小时），未签书面劳动合同不违法。此时，劳动者无法主张双倍工资。
2. 用人单位已尽到签约义务但劳动者拒绝：例如，用人单位多次书面通知劳动者签订合同，但劳动者以各种理由拖延，此时用人单位需保留通知证据，若后续终止劳动关系无需支付经济补偿。但如果用人单位未终止劳动关系仍继续用工，则仍需承担未签合同的责任。
3. 劳动者与用人单位存在特殊关系：如劳动者为用人单位法定代表人或高管，可能因自身职责包括签订合同而无法主张双倍工资。例如，公司总经理负责劳动合同签订事宜，其未签订自己的劳动合同，可能被认定为自身过错，无法获得双倍工资。
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针对入职三年没签劳动合同是否违法的问题，我们可以从《劳动合同法》的具体条款中找到法律依据。
根据《中华人民共和国劳动合同法》第十条规定：“建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。” 该条款明确了用人单位签订书面劳动合同的法定义务。
同时，《劳动合同法》第八十二条规定：“用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。用人单位违反本法规定不与劳动者订立无固定期限劳动合同的，自应当订立无固定期限劳动合同之日起向劳动者每月支付二倍的工资。” 结合问题中“入职三年”的情况，用人单位未签订劳动合同的行为违反了上述法律规定，需承担支付双倍工资及视为订立无固定期限劳动合同的法律后果。
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关于入职三年没签劳动合同是否违法的问题，答案是明确的。以下为您分情况详细说明：
入职三年没签劳动合同属于违法行为。
1. 若用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同：根据《劳动合同法》第八十二条，用人单位需向劳动者每月支付二倍的工资（最多支付11个月）。
2. 若用人单位自用工之日起满一年不与劳动者订立书面劳动合同：视为用人单位与劳动者已订立无固定期限劳动合同，且仍需支付之前11个月的双倍工资差额。
3. 若劳动者拒绝签订劳动合同：用人单位需书面通知劳动者终止劳动关系，若未终止仍继续用工，则仍需承担未签合同的法律责任。
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入职三年没签劳动合同可能存在以下法律风险，我们通过实例为您说明：
1. 双倍工资请求时效风险：例如，劳动者入职三年后才申请仲裁主张双倍工资，根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，仲裁时效为一年，此时劳动者只能主张申请仲裁前一年内的部分双倍工资，前两年的请求可能因超过时效而被驳回。
2. 劳动关系认定风险：若用人单位否认劳动关系，且劳动者证据不足（如无工资流水、工作证），可能导致劳动关系无法认定，进而无法主张社会保险、经济补偿等权益。例如，劳动者仅能提供微信聊天记录证明工作内容，但聊天记录未明确显示用人单位信息，仲裁委可能不认可劳动关系。

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